Харишма Виол Дхеа — магистр наук, аспирант, кафедра биологии, факультет науки и техники
60115, Восточная Ява, Сурабая, округ Мулиорехо, ул. Мулиорехо Тел.: +628–121–78–70–02
Viol D. Kharisma, Master of Science, PhD Student, Department of Biology, Faculty of Science and Technology, Universitas Airlangga Jl. Mulyorejo, Kec. Mulyorejo, Surabaya, East Java, 60115, Tel.: +628–121–78–70–02
Анзори Ариф Нур Мухаммад — PhD, Доктор ветеринарных наук, научный сотрудник, департамент аспирантуры
Университет Айрланга 60115, Индонезия, Восточная Ява, Сурабая, округ Мулиорехо, ул. Мулиорехо Тел.: +628–214–464–78–32
Arif N. M. Ansori, PhD in Veterinary Science, Researcher, Postgraduate School, Universitas Airlangga Jl. Airlangga 4–6, Surabaya, East Java, 60286, Tel.: +628–214–464–78–32
Яхмола Викаш — профессор
248007, Уттаракханд, Дехрадун, ул. Чакрата Тел.: +918–126–00–96–20
Vikash Jakhmola, Professor, Professor, Uttaranchal Institute of Pharmaceutical Sciences, Uttaranchal University Chakrata Rd, Prem Nagar, Dehradun, Uttarakhand, 248007, Tel.: +918–126–00–96–20
Улла Эмдат — магистр наук, аспирант, химический факультет
MS39762, штат Миссисипи, Миссисипи, Президентский центр, 310 Тел.: +1–662–617–56–70
Emdad Ullah, Master of Science, PhD Student, Department of Chemistry
310 President Cir, Mississippi, Mississippi State, United States MS39762 Tel.: +1–662–617–56–70
Гери Пурнобасуки, профессор, кафедра биологии, факультет науки и техники
60115, Восточная Ява, Сурабая, округ Мулиорехо, ул. Мулиорехо Тел.: +6–231–592–68–04
Hery Purnobasuki, Professor, Department of Biology, Faculty of Science and Technology
Jl. Mulyorejo, Kec. Mulyorejo, Surabaya, East Java, 60115, Indonesia Tel.: +6–231–592–68–04
HIV has a host cell, T‑cell lymphocytes with CD4+ receptors. HIV drugs have the inhibitory activity on HIV‑1 protease by producing chemical bonding interactions such as hydrogen and hydrophobic. However, some cases show long-term side effects that may be harmful from the use of synthetic antiretrovirals. This requires new innovations to make drugs based on natural resources or alternative medicine for handling these cases. Natural-based drugs are claimed to reduce the side effects produced. Garcinia mangostana L. or queen of fruit is widely found in Southeast Asia. Many parts of this plant, such as fruits, are used for traditional medicine. Research with in vitro and in vivo approaches reveals that mangostin compounds from Garcinia mangostana L. can be an antiviral candidate. Garcinia mangostana L. has the main chemical compounds of garciniaxanthone, garcinone A, and mangostin. This study uses garciniaxanthone, garcinone A, and mangostin compounds to reveal the molecular mechanism of the antiviral activity in Garcinia mangostana L. through inhibition of HIV‑1 protease with a bioinformatics approach. In silico methods used in this study are druglikeness, molecular docking, interactions, visualization, and dynamic simulation. Garciniaxanthon B, garcinone B, and beta-mangostin from Garcinia mangostana L. have potential as antiretroviral agents for the treatment of HIV‑1 infection. The three compounds are predicted to inhibit the protease activity in HIV‑1 with a more negative binding affinity score, form ligand-protein molecular complexes with van der Waals, hydrogen, pi/alkyl/anion/ sigma bonds, form stable bonds and drug-like molecules.
ВИЧ имеет клетку-хозяина, Т‑клеточные лимфоциты с рецепторами CD4+. Препараты против ВИЧ обладают ингибирующей активностью в отношении протеазы ВИЧ‑1, создавая химические связи, такие как водородные и гидрофобные. Однако в некоторых случаях наблюдаются долгосрочные побочные эффекты, которые могут быть вредными от использования синтетических антиретровирусных препаратов. Это требует новых инноваций для создания лекарств на основе природных ресурсов или альтернативной медицины для лечения этих случаев. Также утверждается, что лекарства на натуральной основе уменьшают возникающие побочные эффекты. Garcinia mangostana L. или королева фруктов широко распространена в Юго-Восточной Азии, многие части этого растения, например плоды, используются в традиционной медицине. Исследования in vitro и in vivo показывают, что соединения мангустина из Garcinia mangostana L. могут быть кандидатами на противовирусные препараты. Garcinia mangostana L. содержит основные химические соединения гарциниаксантона, гарцинона А и мангостина. В этом исследовании используются соединения гарциниаксантона, гарцинона А и мангустина для выявления молекулярного механизма противовирусной активности Garcinia mangostana L. посредством ингибирования протеазы ВИЧ‑1 с помощью биоинформатического подхода. Методы in silico, используемые в этом исследовании, включают подобие лекарствам, молекулярный докинг, взаимодействия, визуализацию и динамическое моделирование. Гарциниаксантон B, гарцинон B и бета-мангостин из Garcinia mangostana L. потенциально могут использоваться в качестве антиретровирусных средств для лечения инфекции ВИЧ‑1. Предполагается, что эти три соединения ингибируют протеазную активность ВИЧ‑1 с более отрицательным показателем аффинности связывания, образуют молекулярные комплексы лиганд-белок с вандерваальсовыми, водородными, пи/алкил/анионными/сигма-связями, образуют стабильные связи и подобные лекарствам молекулы.
The authors declare that there are no conflicts of interest present.